Рациональное водопользование играет важную роль для поддержания стабильной экологической обстановки, улучшения мелиоративного состояния земель, сохранения биоразнообразия, повышения плодородия. Подобное планирование подкрепляет основные направления развития Туркменистана и программные работы, намеченные к реализации в предстоящие 30 лет. Строительство Туркменского озера «Алтын асыр» – крупнейшего гидротехнического сооружения страны и региона – заметно улучшило мелиоративное состояние орошаемых земель в Туркменистане, создало благоприятные условия для охраны природной среды, в том числе речных экосистем на Амударье в сопредельных странах, так как сбор и транспортировка коллекторно-дренажных вод к впадине Карашор обусловили прекращение сброса их в реку. Государством осуществляются мероприятия по предотвращению загрязнения акватории Каспийского моря согласно положениям Тегеранской и Рамсарской конвенций. Особое внимание уделяется совершенствованию методов экологического системного управления водными биоресурсами, восстановлению рыбных запасов озера Сарыкамыш, крупных озёр и водохранилищ страны, вместе составляющих на основе амударьинской воды гидросистему Каракум-реки.
«Портфель» инициатив государства в области водной проблематики включает усилия по решению проблемы Аральского моря в формате региональных и глобальных структур. Прежде всего Международного фонда спасения Арала (МФСА) – многолетней организации, объединяющей пять государств-участников – Казахстан, Кыргызстан, Таджикистан, Туркменистан и Узбекистан, которой в будущем году исполняется 30 лет с момента создания, а также со структурными подразделениями ООН на основе выполнения Резолюции о сотрудничестве Организации Объединённых Наций и МФСА. Кроме того, Резолюцией ООН от 11 декабря 2008 года Фонду предоставлен статус наблюдателя в Генассамблее. Активное содействие выработке новых подходов и мер для оздоровления экологической обстановки, реализации социально-экономических программ в бассейне Аральского моря оказывает принятая недавно Национальная программа Туркменистана по Аралу, внутригосударственные мероприятия которой будут отражаться на ситуации в регионе.